民国八年春，高诚身夫人、李耀东夫人创办基督女校。
民国八年，南通基督会牧师高诚身筹办英化职校，先择址于大保家巷鸿宅，后迁至孩儿巷一带。
民国十四年八月，英化职校停办。
民国十八年，基督女校迁至英化职校旧址，两校合并办学，更名为南通私立崇英女子小学校，史称崇英女校。学校尊崇“敬诚勤朴”四字校训。
民国二十二年，崇英女校增设初中部。
民国二十三年，更名为"南通私立崇英女子初级中学校"，初中三年制，附设小学及幼儿园。
民国二十四年，“九一八”事变后，女校学生在国文教师吴天石等人带领下，以"学生反日救国会"为阵地，组织开展反日爱国运动。
民国二十七年，日军全面侵华，崇英女校被毁，辗转上海，暂并于华东联合中学，后又流离至福建。
民国三十五年，崇英女校返通复课。
1952年6月，政府接管崇英中学，市区四校并校建部，创建“公立南通市初级中学”，赵宝钰任校长。
1956年，学校更名为“南通第一中学”，并被定为南通市属重点学校。
1980年，被江苏省教育厅定为江苏省属重点中学。
1984年，学校被指定为江苏省教育大改试点单位。
1990年，学校通过省教委对重点中学的检查验收。
1998年，学校被认定为南通市区首家达标的“国家级示范性普通高中”。
1999年，学校更名为江苏省南通第一中学，被中央精神文明建设指导委员会表彰为全国精神文明建设工作先进单位。
2004年，学校作为国家级示范性普通高中被转评为江苏省首批四星级普通高中 [3] 。
办学条件
硬件设施
截至2015年5月江苏省南通第一中学占地近5万平方米，建筑面积4万余平方米。学校有设施先进的现代化教学楼、科学馆、天文馆、图书馆，学生公寓楼，24小时供应热水，并配有空调、标准卫生间；学生饭厅集饮食、休闲等功能于一体。 [4]
学校建有全市中小学第一个校园网和电子阅览室，校园内有多处电子走廊；OEH多媒体电教网络遍布全校60多个教学点。 [5-6]
办学规模
据2016年4月学校官网显示，学校占地近5万平方米，建筑面积4万余平方米，有43个教学班，学生人数近5000人。 [7]
师资力量
据2020年4月学校官网显示，学校有在职高中专任教师187人，其中，有江苏省劳动模范1人，人民教育家培养对象2人，教授级高级教师4人，在职特级教师5人，高级教师117人，省“333高层次人才培养工程”培养对象5人，南通市“226高层次人才培养工程”培养对象6人，大市骨干和学科带头人40余人。 [8]
特级教师（17人）：成锦平、徐宾、张园园、薛海兵、王炎斌、陶耕培、顾元义、黄坪、姜学勤、符勇平、姚天勇、张晓冰、陈辉祖、黄建书、孙晓东、薛海兵、陈文辉 [9]
“333高层次人才培养工程”培养对象（5人）：张晓冰、薛海兵、范永梅、任陈斌、张园园 [10]
对外交流
2014年9月27日，该校师生赴斯洛文尼亚马里博尔第二中学进行友好交流访问。 [7]
2015年2月4日，该校校师生前往德国海因里希·海纳一级文理中学进行第三次访问交流。同年10月14日德国海因里希·海纳一级文理中学4师生到江苏省南通第一中学进行第三次访问交流。 [11]
办学成果
学生成绩
- 高考成绩
2016年高考，有665人参加高考，245人上本一线，本一率达37.00%；579人上本二线，本二率达88.00%。其中390分以上有3人，380分以上有3人。 [13]
2015年高考，有747人参加高考，229人上本一线，628人上本二线，本科上线率超过84.00%。2015届38名国际班毕业生均被世界排名前100的大学录取，有两名同学被伦敦大学学院录取；两名同学获得牛津大学入学测试通知。 [14]
2014年高考，有714人参加高考，227人上本一线，本一上线率达32.00%；621人上本二线，本二上线率达87.00%。2014届国际班毕业生均被世界百强学校录取，一名同学被加拿大哥伦比亚大学录取；两名同学被伦敦大学录取。 [15]
2013年高考，有723人参加高考，253人上本一线，上线率35.00%；623人上本二线，上线率86.00%。2013届PGA国际班100%的同学被美国排名前100名的大学录取。2013届A-LVEVL国际班100%的同学被世界前百强学校录取，其中80.00%的学生被世界50强大学录取。 [16]
2012年高考，有268人上本一线，上线率40.00%，548人上本二线，本科上线率约80.00%。3位同学被南大、浙大等国内名校保送录取。首届PGA国际课程班24位毕业生100%被世界名牌大学录取。 [17]
- 学科竞赛
2015年4月25-26日，该校获得，“2015年世界学者杯上海赛区”高中组写作团队第一名。
2015年4月17日，该校两名同学获得“欧几里德数学竞赛”卓越奖，8位同学获得“伽罗瓦数学竞赛”卓越奖。
2015年7月26日，该校一名同学获得“2015中国机器人大赛医疗与服务项目类选拔赛”冠军。 [18]
- 素质成绩
2015年5月9日，该校两名同学获得南通市第二届普通高中学生现场绘画比赛一等奖。
2015年7月12日，该校乒乓球队获得“2015年南通市中小学生乒乓球比赛”高中女子组团体第一名和高中男子组团体第三名。
2015年7月17日，该校篮球队获得“2015年南通市中小学生三人制篮球比赛”高中男子组第二名。
2015年11月26日，该校获得“2015年南通市中小学生排球比赛”高中男子组冠军。 [
2014年11月30日，该校男排以三战全胜的成绩获得南通市中学生排球赛高中男子组冠军。